论文查重时，引用率是计算在内的。查重系统会识别论文中的引用部分，并计算文献部分的引用率，通常以两个指标来衡量：他引率和自引率。他引率是指论文中引用其他文献的比例，而自引率是指引用作者之前发表文献的比例。引用部分在查重报告中通常以绿色字体标注，以区分原创内容和引用内容。
引用是否计入查重率取决于查重软件的具体实现和学术机构的要求。大多数情况下，正确的引用格式可以避免被误判为抄袭，但若引用格式不正确，则可能会计入查重率。因此，在撰写论文时，应确保使用正确的引用格式，以符合学术规范和查重要求
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